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扩增失败时,大家的第一反应是换酶、改引物,但有一类"隐形嫌疑犯"常被漏掉——dNTP。作为反应的底物,它的状态直接决定扩增效率。

一、反复冻融是头号杀手。dNTP 溶液在冻融循环中会逐渐降解,杂质累积还会抑制聚合酶。规范做法:到货分装成小份,-20℃ 冻存,用完一支再取一支;常温搁置过夜的 dNTP 尽量不要再进正式体系。

二、四种碱基配比要等摩尔。dNTP 混合物里任何一种浓度偏差过大,都会增加错配率或造成底物竞争。买预混 4 种的 mix 可以规避手动配比误差——Jena Bioscience 提供 dNTP 单液与预混 mix 两种规格,高频使用建议直接用 mix。

三、Mg²⁺ 与 dNTP 是绑定关系。Mg²⁺ 总量要覆盖 dNTP 鳌合部分再留出酶活所需,dNTP 浓度提高时 Mg²⁺ 也要联动优化——只调一头,体系照样不干活。

四、排查顺序建议。扩不出条带时:阳性对照→酶活力→dNTP 新旧→Mg²⁺ 梯度→退火温度,按这个顺序排查,多数问题十分钟内能定位。

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